研究背景
β螺旋桨蛋白相关神经变性(BPAN)是一种由WDR45基因变异引起的X染色体连锁神经退行性疾病,传统上认为其主要源于自噬通路功能障碍。然而新证据揭示该理论存在显著矛盾——部分患者自噬功能正常仍出现典型神经退行症状,且WDR45蛋白被证实参与铁死亡抑制、内质网稳态调控等非自噬过程。更关键的是,应激颗粒(SG)的异常滞留已被证实与多种脑病相关,但SG分解的核心分子机制长期未知,这为BPAN的致病通路探索提供了全新方向。
助力研究
近日,北京大学基础医学院张培培课题组在国际顶尖期刊 Nature Communications 上发表了题为“β-propeller protein-associated neurodegeneration protein WDR45 regulates stress granule disassembly via phase separation with Caprin-1”的研究论文。
研究首次阐明WDR45通过其WD5结构域与Caprin-1发生相分离,形成凝胶状凝聚物并竞争性取代Caprin-1结合的G3BP1蛋白,从而直接激活SG分解程序。研究发现BPAN相关突变会破坏该相分离过程,导致SG分解延迟3倍以上,且这种功能障碍在患者iPSC衍生的中脑神经元中直接诱发神经退行性病变。值得注意的是,WDR45缺失还会加剧肌萎缩侧索硬化症(ALS)的病理SG累积,表明该机制具有广谱神经退行性疾病干预价值。这些发现不仅揭示了SG动态调控的关键分子开关,更为BPAN及相关脑病提供了全新的诊断生物标志物与治疗靶点。
Polar-SIM系统在该文章中的贡献
1)G3BP1阳性应激颗粒(红色)与WDR45蛋白(绿色)的共定位情况
为了确定WDR45是否依赖于Caprin-1,研究人员使用CRISPR-Cas9生成了CAPRIN1 KO细胞系,结果显示Caprin-1表达完全丧失。在CAPRIN1 KO细胞中,WDR45在SG中的结合率明显降低。结果表明,Caprin-1是WDR45募集到SG的必要条件。超分辨率结构照明显微镜(SIM)进一步证实了这一发现。在WT细胞中,WDR45与SG高度共定位,皮尔逊相关系数很高(图f,g)。然而,在CAPRIN1 KO细胞中,WDR45与SG之间的皮尔逊相关系数明显降低,这表明在Caprin-1缺失的情况下,WDR45与SG的招募受到了影响(图f,g)。
f Representative SIM (Structure Illumination Microscopy) images of G3BP1-positive SGs (Red) and WDR45 (Green) in WT and CAPRIN1 KO U2OS cells. Scale bar, 1 μm, Zoom’s Scale bar, 0.5 μm.
g Scatterplot representing the co-localization correlation between G3BP1 and WDR45 signal (WT and CAPRIN1 KO cells) during the SA stage as represented in (f). Data are shown as mean ± SD. Statistical significance was determined using an unpaired and two-sided t-test comparison. Each cell represents the Pearson coefficient analysis of cell ROI. ****P < 0.0001. n = 20 from 3 independent experiments.
f 野生型(WT)与CAPRIN1基因敲除(KO)的U2OS细胞中G3BP1阳性应激颗粒(红色)与WDR45蛋白(绿色)的代表性结构光照明显微镜(SIM)图像。比例尺:1 μm;放大图比例尺:0.5 μm。
g 散点图显示应激期(SA阶段)G3BP1与WDR45信号在野生型(WT)和CAPRIN1基因敲除(KO)细胞中的共定位相关性(对应图f)。数据以均值±标准差表示,统计学显著性采用非配对双样本t检验分析,每个数据点代表单个细胞感兴趣区域(ROI)的皮尔逊相关系数。****P < 0.0001(n = 20个细胞,来源于3次独立实验)。
2) G3BP1阳性应激颗粒(红色)与Caprin-1蛋白(绿色)的共定位情况
作者进行了基于SIM的超分辨率成像,结果显示WDR45 KO细胞的G3BP1和Caprin-1间的Pearson相关系数增加(图 g,h)。
g Scatterplot representing the co-localization correlation between G3BP1 and Caprin-1 signal (WT and WDR45 KO cells) during the SA stage. Data are shown as mean ± SD. Statistical significance was determined using an unpaired and two-sided t-test. ***p < 0.001. n = 20 from 3 independent experiments.
h Representative SIM (Structure Illumination Microscopy) images of G3BP1-positive SGs (Red) and Caprin-1 (Green) in WT and WDR45KO U2OS cells. Scale bar, 1 μm, Zoom’s Scale bar, 0.5 μm.
g 散点图显示应激期(SA阶段)野生型(WT)与WDR45基因敲除(KO)细胞中G3BP1和Caprin-1信号的共定位相关性。数据以均值±标准差表示,统计学显著性采用非配对双样本t检验,*p < 0.001(n = 20个细胞,来源于3次独立实验)。
h 野生型(WT)与WDR45基因敲除(WDR45 KO)的U2OS细胞中,G3BP1阳性应激颗粒(红色)与Caprin-1蛋白(绿色)的代表性结构光照明显微镜(SIM)图像。比例尺:1 μm;放大图比例尺:0.5 μm。
3)WDR45通过Caprin-1依赖性途径调节SG分解
基于SIM的超分辨率成像显示,SGs中G3BP1的分子密度在WDR45 KO细胞中显著增加,而在CAPRIN1 KO细胞中减少(图m,n)。这些结果表明,WDR45和Caprin-1在调节SG核心中具有相反的作用,其中WDR45 KO导致加强和更刚性的SG核心,而CAPRIN1 KO导致更松散和更不稳定的核心。
m, Representative SIM images of G3BP1-positive SGs (Red) in WT, WDR45, and CAPRIN1 KO U2OS cells. Scale bar, 5 μm.
n, Quantification of the average fluorescence intensity of each SG in WT, WDR45, and CAPRIN1 KO U2OS cells. Results are presented as mean ± SD, with statistical significance indicated by ****p < 0.0001, determined using one-way ANOVA with Tukey’s test.
m WT、WDR45和CAPRIN1 KO U2OS细胞中G3BP1阳性SG(红色)的代表性SIM图像。比例尺,5 μm。
n WT、WDR45和CAPRIN1 KO U2OS细胞中每个SG的平均荧光强度的定量。结果表示为平均值±SD,统计学显著性表示为*p < 0.0001,使用单向ANOVA和Tukey检验确定。